NPG; Gentech Software

From Talk2000.NL

===Software voor gentechonderzoek=== (download)

In deze pagina zijn verschillende programmatjes te vinden welke te gebruiken zijn bij genetisch onderzoek en de registratie van gegevens. Het geeft een extra inkijk in hoe deze wereld werkt en wat voor ontwikkelingen hier gaande zijn. Mede doelstelling van de gentechbedrijven lijkt het hele leven op deze manier digitaal beschikbaar en manipuleerbaar te maken. Alles is tenslotte niet meer dan een bundel energie zoals Einstein wist te omschrijven, (E=mc2 etc) of een bundel trillingen, geluid of zelfs slechts een gedachte....
Uit die visie, en de overtuiging dat de genen de drager zijn wordt alles mogelijk. Althans in theorie dan. De praktijk laat zien dat e.e.a. niet zo eenvoudig is.
Schrijf ons uw bevindingen en ervaringen!

Software

A key deliverable of the CIPRES project is platform-independent software that can be downloaded and installed in a PC or a large supercomputer

[edit] Meer software voor gentechonderzoek

CIPRES Software Links to Software developed by CIPRES team members are shown below.

GRAPPA is a program to infer phylogenies from unichromosomal gene-order and gene-content data.
POY is a program for cladistics and phylogenetics analysis using sequence and/or morphological data.
MALIGN is a parsimony-based alignment program for molecular sequences.
PAUP provides tools for inferring and interpreting phylogenetic trees.
MacLade is a pioneering program for interactive analysis of evolution of a variety of character types.
Mesquite is a set of modules in Java to carry out a wide variety of analyses in comparative biology.
MrBayesis a program for the Bayesian estimation of phylogeny

HY-PHY has general ways of enabling the user to perform a wide variety of statistical tests of different models of molecular sequence change.
Hickory provides for Bayesian estimation of F-statistics from both dominant and co-dominant marker data.
Hydrodictyon computes linkage and Hardy-Weinberg disequilibrium, some genetic distances, and provides method-of-moments estimators for hierarchical F-statistics.